1999年底，李彦宏从美国硅谷回来，带来了要做搜索引擎的思路和资金。为了招聘第一批工程师，在BBS上发布了招聘信息。崔珊珊当时还在中科院读研究生，看到这个帖子后，被其吸引，并通过面试成为了公司的七位创业人员之一。

2000年1月加入百度，历任初中高各级研发及技术管理职位，是百度核心技术部门（大搜索）的主要负责人，亦是百度工程师文化的关键奠基人之一。

崔珊珊在百度经历了工程师、高级工程师、技术经理、高级经理、技术总监、高级技术总监6个级别的晋升。

2017年12月回归百度，任百度文化委员会秘书长，主管文化建设，并主导百度OKR的落地实施。现任百度副总裁，主管百度人力资源工作。