南京大学鼓楼校区坐落在南京市中心区域，位于鼓楼区，与南京市中心鼓楼广场相邻，汉口路将鼓楼校区划为南园、北园，南园是学生宿舍生活区，北园是教学科研区，面积近800亩。南京大学鼓楼校区为金陵大学旧址所在地，北园金陵苑一带为中华传统风格建筑群，其中的北大楼已经成为南京大学的标志性建筑。

南京大学鼓楼校区有南京大学考古与艺术博物馆、南京大学地球科学博物馆、南京大学校史博物馆等。南园有孙中山就任中华民国临时大总统时的故居，还有设立了拉贝与国际安全区纪念馆的拉贝故居，北园有赛珍珠故居、何应钦故居（斗鸡闸）等。

1910年合并改名金陵大学后，在鼓楼西南购地建造新校舍，同时中国政府以金大教授裴义理主持华洋义赈有功赠地百亩，1913年由纽约建筑师克尔考里完成校园规划，美国建筑师司斐罗、芝加哥珀金斯费洛斯与汉密尔顿（Perkins, Fellows & Hamilton）建筑师事务所的测绘师莫尔负责建造，1921年建成后作为大学部。金陵大学建筑群是最早期融入西方风格的中国传统建筑群，以塔楼为中心形成不完全对称的布局，建筑造型和装饰为中式，材料和构架为西式，许多建筑材料由美国进口。1952年后金大校园成为南京大学校园的一部分。